啤酒花潜隐病毒新疆分离物的全基因组序列分析

摘要：

对新疆啤酒花上获得的HpLV分离物HpLV-XJ进行了全长克隆和基因组序列分析.结果显示:HpLV-XJ的全基因组序列为8612个核苷酸(nt)(不包括poly A),含有6个开放阅读框(ORF),分别编码224 kDa(ORF1)、25kDa(ORF2)、11 kDa(ORF3)、7 kDa(ORF4)、34 kDa(ORF5)、和12 kDa(ORF6)蛋白.序列相似性分析结果表明,HpLV-XJ与HpLV(GenBank:AB032469)序列相似性达98.5％,6个开放阅读框的核苷酸序列相似性分别为98.3％、99.0％、97.6％、96.7％、99.5％和98.4％；由此推导的氨基酸序列相似性分别为98.6％、98.7％、97.2％、95.0％、99.4％和98.1％,各个基因的核苷酸序列和蛋白的氨基酸之间存在着一定的差异.

关键词：啤酒花潜隐病毒、基因组序列分析、新疆

所属期刊栏目：30

分类号：S432.41;TS261.23(病虫害及其防治)

资助基金：石河子大学高层次人才启动基金项目RCZX200808

在线出版日期：2012-10-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：313-316