16株猪2型圆环病毒全基因组克隆及序列分析

摘要：

采用猪2型圆环病毒(PCV2)型特异性引物,通过PCR方法直接从疑似PMWS病猪肺、淋巴结病料中扩增出16株PCV2的全基因组序列,将扩增产物回收连接到pMD19-T,转化到DH5α后进行克隆测序.结果显示:16株PCV2中,有12株基因组全长为1767 bp,1株全长为1766 bp,3株PCV2的基因组全长为1778 bp.同源性分析结果表明,16株PCV2之间的核苷酸同源性为95.7％～100％,与GenBank已发表的9株PCV2分离株基因组同源性为94.3％～99.9％,与2株PCV1分离株基因组的同源性为76.6％～77.3％；遗传进化树显示16株PCV2主要分为2种基因型,其中134-ZF1、134-ZF2、134-ZF3、141-ZF1、141-ZF2、141-ZF3、142-TL1、142-TL2、142- TL3、142-TL4、142-TL5和148-ZF3这12株与AF055394(法国株)同属于PCV2b亚型,亲缘关系较近；133-ZF1、143-2-15、148-ZF1和WJQ001与AY181946(中国株)同属于PCV2d亚型,组成一个分支.所得的16株PCV2的ORF2核苷酸及其所推导的氨基酸序列与参考株同源性分别为90.2％～99.9％和92.1％～100.0％,存在较大的变异.

关键词：猪2型圆环病毒、基因克隆、序列分析、ORF2

所属期刊栏目：30

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

在线出版日期：2012-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：37-42