10.3969/j.issn.1007-7383.2011.06.008
少孢节丛孢菌新疆分离株丝氨酸蛋白酶全长基因的克隆及生物信息学分析
根据已经报道的少孢节丛孢菌丝氨酸蛋白酶基因序列,设计特异性引物,通过PCR技术对少孢节丛孢菌新疆分离株(XJ-XA)丝氨酸蛋白酶(命名为Aoz1)基因序列进行了扩增,并与国内外少孢节丛孢菌不同地域分离株相应序列进行了同源性分析,构建该基因系统进化树.结果显示,XJ-XA Aoz1基因全长为1344 bp,包含2个外显子和1个63 bp的内含子(第517~579位核苷酸),编码426个氨基酸.Aoz1的信号肽位于氨基酸序列的第1~21位氨基酸;氨基酸序列的第160~171位、200~210位和351~361位分别是天冬氨酸(D)、组氨酸(H)和丝氨酸(S)活性位点所在区域,表明该酶属于Subtilase家族;该酶还含有2个潜在的N末端糖基化位点及2个与底物结合的S1区.系统发生分析发现,少孢节丛孢菌不同地域分离株Aoz1基因序列具有较高的亲缘性,与其他捕食线虫性真菌Aoz1基因亲缘性较远.本研究为研发家畜线虫病生物防控制剂奠定了前期基础.
少孢节丛孢菌、丝氨酸蛋白酶、基因克隆、生物信息学
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S852.659.5(动物医学(兽医学))
新疆兵团博士资金项目2009JC09;石河子大学高层次人才专项RCZX200901
2012-05-14(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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