基于全转录组测序分析多形性胶质母细胞瘤增殖及侵袭的相关机制

摘要：

目的 通过对多形性胶质母细胞瘤(GBM)组织及癌旁组织的转录组测序及生物信息数据进行分析,挖掘导致GBM发生的关键基因并明确其功能,深入探讨GBM细胞增殖、侵袭及迁移的分子调控机制.方法 收集4例GBM患者的癌组织及癌旁组织进行全转录组测序分析,筛选差异表达的mRNA、微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA),并对其进行生物信息学分析[基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组数据库(KEGG)通路分析和转录本富集分析等].构建mRNA-miRNA-lncRNA/circRNA的关联网络,寻找与脑胶质瘤发生、迁移和侵袭密切相关的目标分子.结果 筛选出3088个癌组织与癌旁组织差异表达的mRNA,其中表达上调1375个、表达下调1713个;差异表达的lncRNA 106个,其中表达上调52个、表达下调54个;差异表达的circRNA 82个,其中表达上调32个、表达下调50个;差异表达的miRNA 15个,其中表达上调8个、表达下调7个.差异表达的mRNA转录本富集共得到显著性通路19条,涉及Shh(Sonic hedgehog)信号途径、胶质瘤信号途径、胰腺癌信号途径、轴突导向、肿瘤坏死因子(TNF)信号途径等通路.全转录组多元关联分析结果显示,BOC位于调控网络关键节点位置,与has-miR-4763-5p、has-miR-6848-5p、has-miR-6860 miRNA具有潜在的靶向结合位点.胶质瘤患者癌组织BOC mRNA水平明显高于癌旁组织(P<0.05).结论 BOC可能受相关miRNA、circRNA、lncRNA等非编码RNA的调控,影响下游靶基因的表达,进而影响GBM细胞的增殖、侵袭等生物学行为.

关键词：全转录组测序、多形性胶质母细胞瘤、Hedgehog信号通路

所属期刊栏目：37

分类号：Q781(基因工程（遗传工程）)

资助基金：呼和浩特市科技局资助项目2019

在线出版日期：2022-09-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：772-781