ICC患者血浆ctDNA突变检测数字PCR平台的建立及临床应用价值

摘要：

目的 建立KRAS G12D、TP53 C242S、IDH1 R132C突变数字聚合酶链反应(dPCR)检测平台,并初步评估其检测性能及临床应用价值.方法 选取行切除手术的肝内胆管细胞癌(ICC)患者22例,设计KRAS G12D、TP53 C242S、IDH1 R132C突变位点的引物及探针,建立dPCR突变检测平台.并采用不同浓度的自配标准品质粒验证该平台的准确性、精密度、空白限、功能灵敏度及线性范围.将外周血dPCR检测结果 与外周血Oseq-ctDNA及组织Oseq-T靶向测序结果进行比较.ICC患者行切除术后,每6个月采集1次外周血并跟踪随访,评估该突变检测平台对ICC患者术后疗效监测的作用.结果dPCR平台的准确性良好[3种突变(KRAS G12D、TP53 C242S和IDH1 R132C)3个丰度的检测结果与理论值的偏差均<±15％],批内和批间精密度[变异系数(CV)]均<20％,空白限为4拷贝,功能灵敏度为0.1％,且在0.1％～10.0％范围内线性良好.ROC曲线分析结果显示,ctDNA突变谱诊断ICC的曲线下面积(AUC)为0.659,敏感性为31.8％,特异性为100％;与糖类抗原19-9(CA19-9)联合检测诊断ICC的AUC为0.841,敏感性为68.2％,特异性为100％.dPCR平台的检测结果与Oseq-ctDNA测序结果有较高的一致性(kappa=0.792,P=0.007).随访结果显示,有1例ICC患者术后18个月KRAS G12D突变升高,与影像学检查确认的复发时间一致.结论 建立了检测KRAS G12D、TP53 C242S、IDH1 R132C突变的dPCR平台,可用于ICC患者的辅助诊断、疗效评估及术后动态监测.

关键词：循环肿瘤DNA、糖类抗原19-9、数字聚合酶链反应、肝内胆管细胞癌

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分类号：R446.1(诊断学)

资助基金：国家自然科学基金面上项目;国家自然科学基金面上项目;国家自然科学基金青年基金;上海市科委临床医学领域研究项目;2017年上海市"上海青年临床医技人才临床检验专业培养资助计划项目;上海市临床重点专科建设项目医学检验科;2019厦门市医疗卫生重点项目;复旦大学附属中山医院院内临床研究项目

在线出版日期：2020-05-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：354-362