非小细胞肺癌中PTCH1-3’-UTR调控的lncRNAs的ceRNA网络

摘要：

目的 研究PTCH1-3'-UTR对lncRNAs表达水平的影响,通过调控网络的分析,提示PTCH1-3’-UTR的功能.方法 通过芯片筛选非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中调控PTCH1-3'-UTR的lncRNAs,并对部分结果进行荧光定量PCR验证.通过GO和KEGG通路分析调控PTCH1-3'-UTR的lneRNAs可能的生物学功能.通过TCGA数据分析调控PTCH1-3'-UTR的lncRNAs与NSCLC患者生存率的直接关系.结果 荧光定量PCR验证了PTCH1-3'-UTR上调表达的lncRNAs(LOC100507547,FAM41C,DOCK4-AS1,AC009305.1,KLF7-IT1,RP11-749H20.1,LINC01511).GO和KEGG通路分析结果显示,调控PTCH1-3,-UTR的lncRNAs与一系列的生物过程,包括基因转录、信号转导、蛋白质转运、翻译延伸以及钙信号通路、Jak STAT信号通路、p53信号通路、胰岛素信号通路有关.TCGA数据分析的结果表明,调控PTCH1-3,-UTR的lncRNAs中,NSCLC患者中高表达lncRNA-CDKN2BAS或FAM66D者预后较差,而高表达lncRNA-LINC00240、LOC400027、ABCC6P2或FLJ 10038者可能预示高存活率.结论 本研究结果提示了PTCH1-3'-UTR的功能,调控PTCH1-3'-UTR的lncRNA可作为NSCLC预后标志物.

关键词：长链非编码RNA、PTCH1-3’-UTR、内源竞争性RNA网络、表达谱、非小细胞肺癌

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分类号：R73(肿瘤学)

资助基金：Shanghai Municipal Natural Science Foundation14ZR1403700;the General Program of National Natural Science Foundation of China 81773024.上海市自然科学基金14ZR1403700;国家自然科学基金面上项目81773024

在线出版日期：2018-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：305-315