华东部分农村地区结核分枝杆菌的VNTR-MIRU分子特征

摘要：

目的 评价VNTR-MIRU分型方法在结核病流行病学中的应用,并描述华东部分农村地区结核分枝杆菌的基因型分布及成簇特征.方法 对浙江省宁波市鄞州区及江苏省盐城市阜宁县从2009年6月1日至2010年11月31日登记的结核病患者的结核分离菌株采用VNTR-MIRU方法进行分型,通过Hunter-Gaston指数(HGI)及遗传差异值(h)对MIRU位点进行分辨力及遗传差异性评价,同时进行问卷调查以收集患者的社会人口学及临床治疗信息.结果 在297株结核杆菌分离株中发现了281种基因型,近期传播比例为5.4％,MIRU位点组合的分辨力(HGI)为0.9995,7个位点的分辨力大小依次为:VNTR3820＞ Qub18＞ Qub11a＞MIRU26＞Qub11b＞Mtub21＞Qub26,位点的h大小排序与分辨力的大小排序相同,遗传差异性最大的位点为VNTR3820(h=0.8794),最小的为Qub26(h=0.6613).比较两个研究地区的结核枝杆菌成簇特征,阜宁县菌株成簇率为19％,而鄞州区无菌株成簇,均呈现“唯一”基因型,这种差异的产生很可能与当地的人口迁徙有关.结论 7位点VNTR-MIRU分型法对结核枝杆菌进行分型简便快速,而且具有较高的分辨力,适合于结核的大规模快速检测.我国华东农村地区结核的流行以既往感染复燃为主,并存在一定比例的近期传播.

关键词：结核分枝杆菌、VNTR-MIRU、基因分型、成簇

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分类号：R378.91+1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金项目30800937;教育部留学回国人员科研启动基金;上海市公共卫生重点学科建设计划12GWZX0101.This work was supported by the National Natural Science Foundation of China30800937;the Scientific Research Foundation for the Returned Overseas Chinese Scholars,Ministry of Education,and the Key Discipline Constraction of Public Health of Shanghai12GWZX0101

在线出版日期：2013-10-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：400-406