10.3969/j.issn.1672-8467.2006.05.017
影响H5N1甲型流感病毒对哺乳动物毒力变异的HA序列关键位点研究
目的 筛选影响H5N1亚型甲型流感病毒对哺乳动物毒力变异的HA序列主要氨基酸位点.方法 根据相关文献提供的实验结果,将54株H5N1病毒株按其对哺乳动物的毒力强弱分为高毒力组和低毒力组,在NCBI Genbank数据库中下载HA基因序列,用随机森林模型完成主要变异氨基酸位点的筛选.结果 在HA序列中共筛选出8个关键位点,均位于HA1节段,分别为:279、102、228、156、154、172、140、8.位点154和156与其余几个关键位点间、位点140与172间均存在较强的协同交互作用,用上述关键位点重建的随机森林模型对病毒株毒力分类的准确率为83.33%.结论 所筛选出的8个变异位点可能在决定H5N1病毒毒力上起关键作用,值得对其分子生物学作用机理做深入研究.
H5N1、甲型流感病毒、毒力变异、血凝素、随机森林模型
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R373.1+3(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
国家自然科学基金30400370
2006-10-23(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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