乳腺癌基因芯片数据分析

摘要：

目的以乳腺癌病人的表达谱芯片数据为基础,探寻乳腺癌复发的相关基因.方法对标化芯片数据进行缺失值处理后,分别用单因素COX回归模型和综合了聚类及多因素COX回归的综合法来筛选兴趣基因,然后通过兴趣基因对病人做样品聚类,以灵敏度、特异度、约登指数和Kaplan-Meier法评价分类效果,最后结合文献和蛋白质数据库探寻乳腺癌复发的相关基因.结果综合法筛出的30个P<0.01的基因对乳腺癌病人复发状况的预测效果最佳;单因素COX回归筛出的102个P<0.01的基因的预测效果较差;单因素COX回归筛出的15个P<0.001的基因预测效果最差.结论综合法筛选得到的30个基因可用来评价病人的预后状况,为进一步的生物学研究提供待选基因.

关键词：乳腺癌、基因芯片、聚类分析、COX回归模型

所属期刊栏目：32

分类号：R737.9;O212.1(肿瘤学)

在线出版日期：2005-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：169-172