HLA-DRB1基因芯片与PCR-SSP分型的比较

摘要：

目的比较基因芯片和PCR-SSP用于汉族南方人群HLA-DRB1基因分型的结果,评价分型芯片的准确性.方法 77份待分型样本,分别用等位基因特异的PCR-SSP和基因分型芯片对DRB1分型.芯片分型通过组间特异引物扩增基因组DNA,扩增中用荧光标记.扩增标记后的产物与分型芯片的探针杂交,通过杂交产生的荧光信号确定样品的HLA-DRB1基因亚型,比较两种方法分型所获得的结果,不吻合的样本全部经第三方验证或测序.结果 77份样本,两种方法分型全部成功.分型结果的吻合率为93%.不吻合样本6份,其中SSP定型纯合子4份,芯片分型全部为杂合子.经第三方验证,证实芯片对纯合子和杂合子的分型全部正确.另外2份不吻合的样本经测序,证实SSP分型错误1份,芯片分型错误1份.芯片的重复率为96%.结论基因芯片是一种理想的分型方法,具有特异性高、重复性好、操作简便、所需样本量少、一次可作多份样本的优点.

关键词：人类白细胞抗原-DRB1、基因芯片、顺序特异引物聚合酶链反应、基因分型

所属期刊栏目：30

分类号：Q754(分子遗传学)

资助基金：上海市科技发展基金024919005;军队医学科研项目01J003

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：68-70