深圳市大鹏新区2起儿童疱疹性咽颊炎聚集性疫情的病原鉴定与基因分型分析

摘要：

[目的]分析2021年5月深圳市大鹏新区2起儿童疱疹性咽颊炎疫情的病原特征及其基因型.[方法]采集2起疱疹性咽峡炎暴发疫情患儿的5份咽拭子,用实时荧光聚合酶链式反应(PCR)对其进行常见肠道病毒的基因检测,采用逆转录巢式聚合酶链式反应(RT?nPCR)法扩增肠道病毒VP1区,通过测序和比对进行序列分析,运用MEGA7软件中的CLUSTAL W程序进行位点对齐并构建系统进化树.[结果]引起这2起疱疹性咽峡炎疫情的病原体为柯萨奇病毒A4(CVA4).VP1区基因序列分析发现2起疫情样本之间的核苷酸同源性为92％;A幼儿园的3株毒株与深圳2018株(MN840533)进化关系最近,核苷酸同源性为98.11％;B幼儿园的2株毒株与四川2018株(MW178763)进化关系最近,核苷酸同源性为97.88％.系统进化树显示,本研究的5株CVA4病毒均属C2基因亚型.[结论]2起儿童疱疹性咽颊炎疫情都是由CVA4病毒引起,均属C2基因亚型.

关键词：柯萨奇病毒A4、疱疹性咽颊炎、聚集性疫情、基因型、基因序列、系统进化树

所属期刊栏目：34

分类号：R511(传染病)

资助基金：广东省深圳市大鹏新区科技创新和产业发展专项YL202001-02

在线出版日期：2022-09-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：660-664