基于高通量测序技术的北豆根转录组数据分析

摘要：

目的:分析北豆根转录组信息特征.方法:采用二代高通量测序技术对北豆根进行转录组测序,并进行系统的生物信息学分析.结果:转录组测序共得到37346个Unigene,平均长度986 nt,其中有20562个Unigene得到注释.采用微卫星识别工具(MISA)方法共鉴定出81种重复单元共9948个简单重复序列(SSRs).挖掘到21个Unigene参与北豆根活性成分的生物合成,涉及(S)-乌药碱N-甲基转移酶、多酚氧化酶、酪氨酸转氨酶、伯胺氧化酶、天冬氨酸转氨酶(细胞质)、天冬氨酸转氨酶(线粒体)、天冬氨酸转氨酶(叶绿体)和酪氨酸脱羧酶等8种酶基因.结论:揭示了参与北豆根活性成分生物合成的关键基因,为进一步研究活性成分代谢途径和调控机制奠定基础.

关键词：北豆根、蝙蝠葛、转录组、蝙蝠葛碱

所属期刊栏目：23

分类号：R285(中药学)

资助基金：山西省中药粉末饮片质量标准研究项目2018016D

在线出版日期：2022-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：317-323