实验小鼠核酸样品单核苷酸多态性标记检测的能力验证结果评价

摘要：

目的 通过实施全国范围的小鼠DNA核酸样品单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记检测能力验证计划,检测各实验室小鼠遗传质控SNP检测技术水平,推动核酸样品及SNP检测技术的应用.方法 按照中国食品药品检定研究院2022年组织实施的"NIFDC-PT-365实验小鼠DNA样品SNP标记检测能力验证计划"方案要求,各参加实验室均获得BALB/c和C57BL/6来源的随机编号DNA盲样2份、作业指导书、rs3023177和rs3023382 SNP位点引物2对.参与者在规定时限内提交报告和原始记录,突变位点扩增测序结果与方案预设一致时判为满意,否则判为不满意.同时,对各实验室的PCR扩增体系及测序比对方式进行比较,分析可能影响小鼠核酸标准样品SNP检测结果的相关因素.结果 10个参加实验室在2个SNP位点的盲样测序分型上皆与预设一致,均获得满意结果.不同扩增体积(20μL、25μL、30μL)、不同Taq酶体系(单组分与PCR MIX),以及不同的测序公司、测序方向、比对软件均未影响结果准确性.结论 各参加实验室在小鼠DNA核酸样品SNP标记检测项目上均具有较强的检测能力.SNP检测技术在小鼠遗传质量评价中简便易行,值得推广.

关键词：能力验证、遗传质控、核酸样品、单核苷酸多态性、小鼠

所属期刊栏目：42

分类号：Q95-33(动物学)

资助基金：国家重点研发计划2021YFF0703200

在线出版日期：2023-01-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：505-510