somatostatin1基因突变斑马鱼仔鱼转录组分析

摘要：

利用CRISPR/Cas9基因编辑技术在斑马鱼中构建了可稳定遗传的生长抑素(somatostatin,SST)基因(sst1)突变体鱼系.通过比较6 dpf(days post fertilization,dpf)的sst1-/-突变体和野生型仔鱼转录组,发现sst1-/-突变体相关生化过程和信号通路发生了显著变化.相比野生型,sst1-/-突变体仔鱼中有354个基因显著上调,504个基因显著下调.GO(gene ontology)富集分析表明,大部分差异基因与氨基酸和蛋白质生物合成相关.KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集显示代谢通路、氨基酸合成、氨基酰基-tRNA合成、核糖体合成和rRNA加工相关通路表达增强.结果 表明,sst1-/-突变体蛋白质生物合成和代谢过程更加活跃.RT-qPCR验证结果显示,随机选取的10个基因mRNA表达变化趋势与转录组测序结果一致,说明转录组测序结果真实可靠.6月龄突变体体质量、体长和野生型相比并无显著差异.本研究结果为进一步挖掘生长抑素基因家族的潜在功能奠定基础.

关键词：Somatostatin1、斑马鱼、代谢、蛋白质合成

所属期刊栏目：30

分类号：S917(水产基础科学)

资助基金：上海海洋大学水产一流学科;国家自然科学基金

在线出版日期：2021-12-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：777-788