牡蛎中GⅡ型诺如病毒巢式RT-PCR检测方法的优化与评价

摘要：

为了解决目前巢式RT-PCR法检测牡蛎样品中GⅡ型诺如病毒时存在的非特异性扩增及假阴性等问题,对NCBI数据库中在线获得的所有GⅡ型诺如病毒序列进行系统分析,重新设计出针对GⅡ型诺如病毒检测的通用型巢式RT-PCR引物(NG2OF/NG2OR),并从基因型覆盖度、特异性、灵敏度和实际样品检测的稳定性几个方面对新设计的引物进行评估.结果 显示:新引物的特异性好,只对GⅡ型诺如病毒进行有效扩增,且不受牡蛎样品本底的影响;新引物灵敏度高,最低可检测至26.4个拷贝;在对92个牡蛎样品进行检测时,新引物的阳性检出率为28.3％,比经典引物高出7.5％.因此,新建立的GⅡ型诺如病毒巢式RT-PCR检测方法在检测牡蛎样品时特异性更强,灵敏度更高,为牡蛎中诺如病毒的检测提供了一种新的、可靠的技术手段.

关键词：牡蛎、GⅡ型诺如病毒、巢式RT-PCR、特异性、阳性率

所属期刊栏目：30

分类号：S917(水产基础科学)

资助基金：国家重点研发计划;国家自然科学基金

在线出版日期：2021-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：239-246