亚东鲑基因组中Tc1-like转座子的序列歧化特征分析
根据鱼类Tc1-like超家族转座子的末端反向重复序列设计单引物,对西藏亚东鲑基因组进行PCR扩增、回收、克隆和测序,鉴定出亚东鲑两条长度为1 607 bp和1 473 bp的Tc1-like超家族转座子序列,命名为Tbt1和Tbt2.序列分析表明,亚东鲑Tbt1转座子左右两端分别存在一个196 nt和225 nt的末端反向重复序列(Inverted terminal repeats,ITR),在左右ITR中分别包含2个12 nt的亚末端反向重复序列(Subterminal inverted repeats,SIR);亚东鲑Tbt2转座子分别存在一个32 nt和31 nt短的ITR,其左右ITR中各仅包含1个12 nt的SIR.亚东鲑Tbt1、Tbt2转座子的转座酶编码区在进化过程中各已积累了4个和9个终止突变,两者均不能表达完整的转座酶.亚东鲑Tbt2与其它鲑科鱼类Tc1-like转座子的相似度低于30％,而与金鱼Tca2转座子的序列相似度高达98％,显示该转座子的获得可能起源于基因水平转移(horizontal gene transfer,HGT)方式.
亚东鲑、Tc1-like转座子、序列分析
23
S917(水产基础科学)
农业公益性行业专项课题201203086;国家自然科学基金31272633,31201760;上海高校知识服务平台ZF1206
2014-03-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
15-21
