三角帆蚌AMP基因cDNA全序列的克隆及分子特征研究
以三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)为研究材料,根据实验室构建的三角帆蚌cDNA文库中已标注的EST序列,利用RACE克隆了三角帆蚌AMP基因的cDNA全序列.该cDNA序列全长为970 bp,5′端非翻译区123 bp,3′端非翻译区526 bp,开放阅读框(ORF)长为300bp,共编码99个氨基酸,包含一段由27个氨基酸组成的信号肽和72个氨基酸的成熟肽,分子量为10 924.7 u.氨基酸序列分析表明,该序列存在明显的跨膜结构和疏水区.同源性分析表明,该基因编码的蛋白与海兔(Aplysia californica)theromacin氨基酸序列的相似度最高为56%,而与贻贝等中发现的抗菌肽defensins、mytilins、myticins和mytimycins相似度较低,推测属于抗菌肽theromacin基因家族.Jpred3软件对三角帆蚌AMP蛋白的二级结构预测结果表明,在第2～22、57～62氨基酸残基处存在α螺旋,因此,三角帆蚌的AMP蛋白是包含跨膜螺旋的膜蛋白.为进一步研究该基因的表达、功能及三角帆蚌病害防御奠定了分子基础.
三角帆蚌、AMP基因RACE、分子特征
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S917(水产基础科学)
国家重点基础研究发展计划（973计划）;国家自然科学基金
2011-08-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
342-349
