团头鲂主要组织相容性复合体Ⅰ类基因全长cDNA的克隆及组织表达分析
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团头鲂主要组织相容性复合体Ⅰ类基因全长cDNA的克隆及组织表达分析

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为了解团头鲂MHC Ⅰ类基因的结构,采用cDNA末端快速扩增(Rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术,首次成功克隆了团头鲂"浦江Ⅰ号"F0基础群体及选育F8世代的MHC Ⅰ类基因,共获得3条cDNA全长序列.序列全长为2 040~2 079 bp,含有87~102 bp的5'UTR,1 035~1 044 bp的编码区(包括信号肽,alpha 1、alpha 2和alpha 3三个结构域,跨膜区和胞质区)及911~946 bp的3'-UTR区,分别编码347、344个氨基酸.F8世代序列的核苷酸/氨基酸的同源性很高,为89.0%/93.0%,而与F0世代的同源性较低(75.3%~77.0%和71.1%~71.4%),呈现出明显的分子多态性.分析表明,团头鲂具有经典的MHC Ⅰ类分子的空间结构,与人类HLA-A2的抗原肽结合区的晶体结构相比,二者的差异主要集中在5个(Ⅰ~V)区上.在Neighborjoining(NJ)法构建的分子进化树中,团头鲂与草鱼的亲缘关系最近,与鲑鳟鱼类、爬行类、鸟类、哺乳类及人类的亲缘关系则渐远.RT-PCR组织表达分析表明,团头鲂MHC Ⅰ类基因在所检测的的8个组织中均表达,在鳃、头肾和血液中有较强的转录本,中等强度表达于肝脏和脾脏,在后肾、肠和肌肉中表达较弱.

团头鲂、主要组织相容性复合体、cDNA、克隆、组织表达

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S917(水产基础科学)

国家自然科学基金;上海市重点学科建设项目

2011-05-27(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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上海海洋大学学报

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