利用PCR-DGGE法分析暗纹东方鲀的弧菌菌落组成

摘要：

采用16S rDNA特征序列PCR-DGGE法,分析了不同饵料饲养的暗纹东方鲀的表皮、性腺和肠道中,以弧菌为主的细菌群落的组成.结果表明:(1)共鉴定出暗纹东方鲀体内18种微生物,均归属于变形细菌的gamma亚群,其中13种为弧菌科细菌, 3种为肠杆菌科细菌,2种为气单胞菌属细菌;(2)投喂鲜活鱼虾的与投喂人工配合饲料的暗纹东方鲀肠道和性腺中的细菌组成是不同的,在性腺中分离到的所有12种细菌中,只有2种细菌是相同的,约占17%;在肠道中分离到的所有13种细菌中,有4种是相同的,约占31%.而在表皮上所分离到的11种细菌中,有7种细菌是相同的,约占64%;(3)DGGE特征条带V1、V13、V18、V14和V17所代表的细菌只在表皮组织被分离到,V6所代表的细菌仅出现在以鲜活鱼虾作为饵料的暗纹东方鲀性腺中,V5所代表的细菌仅出现在以鲜活鱼虾作为饵料的暗纹东方鲀肠道中;(4) DGGE特征条带V5、V8、V13、V18、V6、V14和V17所代表的细菌不能在TCBS培养基上培养,占18种被鉴定的细菌总数的39%.

关键词：暗纹东方鲀、弧菌、16S rDNA、变性梯度凝胶电泳、细菌群落

所属期刊栏目：15

分类号：S917(水产基础科学)

资助基金：上海市教委资助项目Y1101;引进国际先进农业科技计划948计划2004-Z44

在线出版日期：2006-08-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：257-263