猪圆环病毒2型和3型混合感染与遗传进化分析

摘要：

为了解临床猪圆环病毒混合感染及其遗传进化情况,利用PCV检测试剂盒对 10 份疑似感染PCV的患病猪的病料进行检测,并对阳性样品进行全基因组克隆与测序分析.结果显示:10 份样品中,PCV1 均为阴性,PCV2 阳性率为90%,PCV3 阳性率为30%,PCV2 与PCV3 混合感染率为30%.全基因组遗传进化结果显示:9 株PCV2 毒株全序列间的核苷酸同源性为 94.5%—100.0%,分属PCV2a、PCV2b、PCV2d和PCV2e基因型,其中PCV2d为优势基因型,占比达55.56%.3 株PCV3 毒株全序列之间核苷酸同源性为99.2%—99.8%.对Cap蛋白氨基酸序列分析发现,PCV3 毒株与PCV2 毒株的亲缘性较远,氨基酸同源性仅为 43.9%—45.1%.PCV3毒株的Cap蛋白抗原指数与参考菌株间差异较小,5 株PCV2d毒株的Cap蛋白抗原指数较疫苗株有明显差异.综上,在临床PCV2 患病猪中PCV2d为优势基因型,且存在一定比例的PCV2 与PCV3 混合感染现象.

关键词：猪圆环病毒、流行特点、遗传进化分析、抗原指数

所属期刊栏目：39

分类号：S852.651(动物医学（兽医学）)

资助基金：上海市科技兴农项目;上海市农业科学院卓越团队建设项目

在线出版日期：2023-07-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：67-72