利用InDel标记分析23份黄瓜种质的遗传多样性及核心种质资源筛选

摘要：

为了研究不同来源黄瓜的亲缘关系,筛选适宜作杂交亲本的种质资源,基于黄瓜重测序开发的InDel标记,应用UPGMA进化树聚类、主成分分析和群体遗传结构分析3种方法分析了23份黄瓜种质的遗传多样性.结果 表明:23份黄瓜种质的遗传相似性系数为0.23-0.95,平均值为0.56,相似性系数低于0.6的有137对组合,占全部组合的54％,说明这些材料的遗传多样性较好.3种分析方法均将23份黄瓜种质分为三大类群:P1来源于亚洲,都属于华南类型黄瓜;P2来源于欧洲和美国,包含欧洲类型长黄瓜、欧洲类型短黄瓜和2个美国加工型黄瓜;P3仅包含1个来源于广东的品种,从表型上看属于华南类型.P3亲缘关系更接近P1,P1和P2之间遗传差异明显.利用InDel标记分析的结果,对核心种质最佳样本量进行了预测,应用M策略将9份黄瓜种质确定为核心种质,包含了群体中几乎所有的黄瓜类型,外形上有白刺、褐刺以及光滑型,这9份核心种质能够很大范围地覆盖表型的变异.

关键词：黄瓜、InDel标记、核心种质、遗传多样性

所属期刊栏目：35

分类号：S642.2

资助基金：上海市科委项目16391901100;上海市农委种业发展项目沪农科种字2017第3-1-2号;上海农科院卓越团队项目农科创B-26

在线出版日期：2019-09-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：28-33