利用水稻抗旱种质研究驯化和育种对遗传多样性的影响

摘要：

利用高通量测序获取SNP标记技术对上海市农业生物基因中心99个水稻抗旱种质进行全基因组重测序,分析其遗传多样性和遗传基础.结果表明:在所有SNPs位点中,多态性比率为68.98％(1 927 238/2 793 702),SNPs标记密度在12条染色体上分布范围为4.5—6.2个SNP/kb;供试品种间的遗传距离分布具有两个密度高峰;邻接法构建系统发育树将99个品种划分为籼稻和粳稻两个类群.综合SNPs和进化分析结果表明:水稻在自然选择和人工驯化过程形成复杂进化史,99个抗旱种质在DNA水平上的差异呈现两个极端,遗传距离分布范围较大(0.003—0.998),具有较宽遗传基础和丰富的遗传多样性.本研究以期为水稻节水抗旱新品种选育的亲本选配提供理论依据.

关键词：水稻、遗传多样性、抗旱性、育种、单核苷酸多态性

所属期刊栏目：32

分类号：S511(禾谷类作物)

资助基金：上海市自然科学基金项目14ZR1437000;上海市种业发展项目沪农科种字2014第1号,沪农科种字2016第1-6号

在线出版日期：2016-10-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

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