大麦SERK基因家族cDNA克隆及生物信息学分析

摘要：

通过对大麦体细胞胚胎发生受体类蛋白激酶SERK(Somatic embryogenesis receptor-like kinases)基因家族进行注释和基因克隆,得到3条大麦序列,即HvSERK1、HvSERK2和HvSERK3,其中基因HvSERK3与相应已有参考序列(Accession:AK374641)相比,编码氨基酸有所改变.生物信息学分析表明:3条大麦SERK基因都具有1 870 bp左右的开放阅读框,620 aa左右的氨基酸残基数,69 kD左右的相对分子质量大小,平均理论等电点5.5,说明SERK为酸性蛋白;大麦SERK蛋白具有强烈的亲水性,且存在N端信号肽和跨膜螺旋区,二级结构组件主要是环(loop).本研究为进一步探讨大麦中SERK基因家族的功能奠定了基础.

关键词：大麦、SERK、注释、克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：32

分类号：S512.3(禾谷类作物)

资助基金：上海市自然科学基金15ZR1436600;上海市种业发展项目沪农科种字2016第1-1号;大麦青稞产业技术体系CARS-05

在线出版日期：2016-08-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：5-13