小鹅瘟病毒GPV-YG株主要开放性阅读框架核苷酸序列分析

摘要：

通过PCR技术分段扩增小鹅瘟病毒(Goose parvovirus,GPV)扬州分离株GPV-YG的2个主要开放性阅读框架(open reading frame,ORF)基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,其结果在GenBank登录.将上述序列与登录的国外参考株GPV-B株作比较,GPV-YG主要ORF核苷酸序列与GPV-B的同源性为94%,显示二者亲缘关系密切.在此基础上,分别确定了GPV-YG编码结构蛋白和非结构蛋白的基因组序列,并推导出GPV-YG结构蛋白和非结构蛋白的相应的氨基酸序列,GPV-YG与GPV-B结构蛋白的氨基酸序列同源性为96.4%,非结构蛋白同源性为97.9%,由此进一步分析了GPV-YG结构蛋白和非结构蛋白的氨基酸序列与功能特征.同时,将GPV-YG主要ORF与番鸭细小病毒(Muscovy Duck Parvovirus,MDPV)-FM作比较,核苷酸序列同源性为80%,非结构蛋白推导氨基酸序列同源性为89.6%,结构蛋白为84.6%.

关键词：小鹅瘟病毒、开放性阅读框架、核苷酸序列

所属期刊栏目：21

分类号：S835;S852.65(家禽)

资助基金：上海市农业科学院青年科技基金

在线出版日期：2005-06-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：11-15