意大利蜜蜂4、5和6日龄幼虫肠道发育过程中差异表达基因的趋势分析

摘要：

为探讨意大利蜜蜂(简称意蜂)幼虫肠道发育过程中的基因表达谱和基因差异表达信息,研究基于前期已获得的高质量的意蜂幼虫肠道转录组数据,利用STEM软件对意蜂4、5和6日龄幼虫肠道的差异表达基因(DEGs)进行趋势分析,进一步通过相关生物学软件对显著上调趋势包含的DEGs进行GO与KEGG代谢通路富集分析及表达量聚类分析.趋势分析结果显示,5 920个DEGs共聚类在8个基因表达模式,其中935个DEGs聚类在1个显著上调趋势.GO富集分析结果显示,显著上调趋势包含DEGs富集于39个GO条目,富集基因数最多的为结合,其次是细胞进程和单组织进程.KEGG代谢通路富集分析结果显示,显著上调趋势包含DEGs富集于94个代谢通路,富集基因数最多的是嘌呤代谢、内质网蛋白质加工和内吞作用.表达量聚类分析结果显示,随着意蜂幼虫肠道发育时间的延长,代谢和免疫相关通路富集基因的表达水平逐渐增强.研究提供了意蜂幼虫肠道发育过程的基因表达谱和基因差异表达信息,揭示了基因表达规律,为深入研究意蜂幼虫肠道发育的分子机制打下了一定基础.

关键词：意大利蜜蜂、幼虫、肠道发育、差异表达基因、趋势分析

所属期刊栏目：36

分类号：S891.3(养蜂、益虫饲养)

资助基金：国家自然科学基金31702190;现代农业产业技术体系建设专项资金CARS-44-KXJ7;福建农林大学科技创新专项基金CXZX2017343,CXZX2017343;福建农林大学科技发展基金项目KF2015123

在线出版日期：2018-10-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：14-21,29