小鼠不同肠道段内容物和粪便中微生物的宏基因组测序和比较分析

摘要：

随着二代测序技术的迅速发展,从宏基因组角度了解环境微生物成为可能.目前,动物肠道微生物研究大多以粪便作为实验样品,对肠道内部微生物情况了解甚少.研究以小鼠为模型,分别对十二指肠、空回肠、盲肠、结肠4个部分内容物进行了宏基因组测序和分析.结果显示,(1)在门水平上,十二指肠比其他肠段厚壁菌门减少、变形菌门增多;(2)在属水平上,大肠的优势菌属为螺杆菌、真细菌等,小肠优势菌属为链球菌、大肠杆菌、梭菌、肠球菌等,而且粪便与大肠优势菌分布趋势类似;(3)大肠和小肠肠道微生物相似度为0.62～0.77,粪便与各肠段微生物相似度为0.7～0.9;(4)粪便和肠道内容物细菌功能差异同其生理功能有一定关联.研究表明,小肠内容物与大肠内容物和粪便中微生物有明显差异,尽营粪便微生物与大肠内容物微生物类似.这一结果暗示着粪便微生物不能完全代表动物宿主肠道微生物的真实情况.

关键词：肠道微生物、宏基因组测序、肠道段、粪便、小鼠

所属期刊栏目：34

分类号：Q347(遗传学分支学科)

资助基金：国家“863计划”重点项目2011AA100901;国家自然基金项目31572384

在线出版日期：2016-08-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：15-21