共表达网络鉴定食管鳞癌中抗肿瘤细胞毒性分子

摘要：

目的 鉴定新的抗食管鳞癌(ESCC)免疫细胞毒性相关分子.方法 基于ESCC转录组表达谱数据,利用CIBERSORT反卷积算法计算ESCC样本中免疫细胞构成比;通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)构建基因模块;计算免疫细胞构成比与细胞毒性基因、共表达网络模块的相关性,确定关键模块.通过基因的模块隶属度、基因显著性和预后相关性,鉴定关键基因.结果 WGCNA方法共构建30个基因模块,其中white模块包含了本研究纳入的所有细胞毒性相关基因(GZMA、PRF1、GZMB和IFNG),将其作为关键模块.关键模块共包含18个关键hub基因,其中8个基因表达异常与ESCC患者预后相关.结论 通过基因共表达网络方法,鉴定到8个ESCC细胞毒性相关基因.

关键词：食管鳞癌、基因共表达网络、免疫细胞毒性

所属期刊栏目：5

分类号：R735.1(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金

在线出版日期：2023-04-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：11-18