直接PCR法在口腔牙龈卟啉单胞菌检测中的应用

摘要：

目的 为了便于食管癌大规模流行病学筛查工作的开展,探讨一种能快速敏感地检测口腔牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,P.gingivalis)DNA的免核酸抽提直接PCR方法.方法 收集我院门诊100例体检人员的200份口腔拭子(每人双份),以TE buffer(10 mM Tris,0.1 mM EDTA,pH 8.0)、商品化裂解液以及核酸抽提试剂盒等作为基因组提取试剂,使用P.gingivalis特异引物探针进行直接定量PCR检测.结果 与裂解液-直接qPCR法相比,TE-直接qPCR法的灵敏度为94.12％,特异性为100％;与试剂盒-qPCR法相比,TE-直接qPCR法的灵敏度与特异性均为100％;TE-直接qPCR法与裂解液-直接qPCR法以及与试剂盒-qPCR法检测P.gingivalis均具有高度一致性(分别为Kappa=0.954,Kappa=1);TE-直接qPCR法与试剂盒-qPCR法检测阳性P.gingivalis的Ct均值无显著差异(P=0.907).结论 TE-直接qPCR法检测口腔P.gingivalis灵敏度高、特异性强,是快速高效检测口腔P.gingivalis的理想方法,可用于食管癌大规模分子流行病学研究.

关键词：食管癌、牙龈卟啉单胞菌、直接PCR、分子流行病学

所属期刊栏目：2

分类号：R-331(医学研究方法)

资助基金：国家自然科学基金项目81972571河南省卫健委联合共建项目2018020299

在线出版日期：2020-09-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：38-42