基于聚类分析的DNA序列分类研究

摘要：

从DNA序列片段的个案中密码子分布密度角度出发,提取出DNA序列片段的特征,应用模糊数学中的模糊聚类分析理论对DNA序列片段进行分类.由DNA序列片段中64种密码子出现的频率,给出两个案夹角余弦的定义,由两个案的交角余弦来描述个案之间的相关性.采取分层聚类分解法,应用SPSS统计软件,计算出描述个案之间相关性的模糊矩阵,同时给出DNA序列片段的分类结果.仿真结果表明,该算法具有分类简单且分类结果精度高的优点.

关键词：DNA序列、密码子、聚类分析、模糊矩阵、频率

所属期刊栏目：20

分类号：Q39(人类遗传学)

在线出版日期：2009-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：104-106