基于小波变换的蛋白质与DNA相互作用的计算机预测

摘要：

蛋白质与DNA的相互作用在细胞的转录调控和DNA修饰等活动中至关重要.将改进的共鸣识别模型应用于预测酵母蛋白质与DNA的相互作用,运用小波变换找出阳性数据和随机数据的信噪比分布的差异,并通过阈值的选取达到了较好的预测结果.同时,将阳性数据与相应复合物的序列进行序列联配,找到了保守位点,进而从结合位点的角度验证了本方法的正确性.

关键词：共鸣识别模型、离散小波变换、蛋白质与DNA相互作用、信噪比

所属期刊栏目：16

分类号：Q51(蛋白质)

资助基金：国家自然科学基金资助项目30871341;上海市重点学科建设资助项目S30104;上海市教委重点学科建设资助项目J50101

在线出版日期：2010-08-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：281-285