红芸豆miR395家族成员的鉴定及其与结瘤相关的表达分析

摘要：

microRNA395是高等植物保守的miRNA家族,主要通过靶向低亲和力硫酸盐转运蛋白(AST)和ATP磺酰化酶(APS)来响应植物的硫饥饿反应,硫饥饿会显著影响固氮植物的结瘤共生固氮过程.为解析miR395在豆科植物结瘤共生固氮中的作用,对红芸豆miR395家族成员进行生物信息学预测,并对pvu-miR395在红芸豆不同组织和根瘤菌侵染不同时间段进行差异表达分析.结果显示,在全基因组水平上鉴定出8个pvu-miR395的家族成员,位于第2、3号染色体上.pvu-miR395家族成员成熟序列和星标序列高度保守,它们的前体序列均可生成稳定的二级结构.进一步对芸豆与大豆、苜蓿、拟南芥、水稻miR395家族成员进行系统进化分析,可将miR395家族成员分为Group Ⅰ～Ⅳ 4个亚家族.顺式作用元件分析发现,该家族成员可能参与植物激素、胁迫、生长和发育等过程;qRT-PCR差异表达分析发现,pvu-miR395家族成员均在根瘤中表达量最高,具有组织特异性,且pvu-miR395的表达量随根瘤菌处理时间延长呈现先升高后降低的趋势,显著抑制根瘤菌的侵染.靶基因预测表明,硫酸盐转运蛋白和硫酸腺苷酰基转移酶可能是pvu-miR395的靶基因.

关键词：红芸豆、miR395、生物信息学分析、靶基因、结瘤、表达分析

所属期刊栏目：51

分类号：S643

资助基金：国家自然科学基金;山西省科技重大专项;山西省科技创新人才团队项目;山西省基础研究计划项目

在线出版日期：2023-10-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1170-1177