糜子PmNAC1的克隆及生物信息学分析

摘要：

糜子为禾本科草本植物,抗旱、耐盐碱、耐瘠、生育期短.为了给糜子抗逆分子育种提供候选基因,试验在前期转录组测序注释基因的基础上,利用糜子基因组染色体16上注释的NAC蛋白结构域比对得到PmNAC1基因的gDNA序列,通过PCR扩增、基因克隆获得糜子的核苷酸序列,使用在线软件ORF Finder Blast对糜子NAC编码蛋白的理化特性及结构等进行生物信息学分析.结果表明,PmNAC1基因全长1 634 bp,编码423个氨基酸,无信号肽和跨膜结构;二级结构中氨基酸主要由8个α-螺旋和14个β-折叠组成,为亲水性蛋白,保守位点在第73～211位氨基酸,共有59个磷酸化位点;超出水平线0.5的是糖基化位点;构建了糜子转录因子NAC氨基酸序列系统发育进化树,PmNAC1蛋白与柳枝稷CUC2的亲缘关系最近,二者的遗传变异系数为0.06.

关键词：糜子、PmNAC1、克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：51

分类号：S516(禾谷类作物)

资助基金：现代农业产业技术体系;山西省现代农业产业技术体系建设杂粮项目;山西省重点研发项目

在线出版日期：2023-10-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1162-1169