10.3969/j.issn.1002-2481.2023.09.08
葡萄VvWRKY70基因生物信息学及表达特性分析
WRKY是植物特有的转录因子,在多种生物和非生物胁迫中发挥作用.基于RNA-seq技术,课题组前期研究发现,SO2熏蒸结合低温保鲜过程中多个功能未知的葡萄WRKY基因差异表达.经氨基酸序列同源性比对,研究选择与AtWRKY70氨基酸序列相似度最高的VvWRKY70进行生物信息学及表达特性分析.生物信息学分析结果表明,VvWRKY70基因启动子区含有W-box元件及茉莉酸甲酯、水杨酸等激素响应元件;编码蛋白由322个氨基酸组成,分子质量约36.57 ku,属亲水性蛋白;该蛋白丝/苏氨酸含量丰富;二级结构主要由无规卷曲和α-螺旋组成,N端含有高度保守的WRKY结构域,C端为C2HC型锌指结构,属WRKY第Ⅲ亚家族;预测显示,其主要定位于细胞核中,且在进化上较为保守.qRT-PCR分析表明,VvWRKY70在玫瑰香葡萄根、茎、叶、花蕾、果中均有表达;葡萄果实VvWRKY70受SO2 和灰霉菌诱导上调表达,低温处理组下调表达.综上可见,VvWRKY70可能作为转录因子参与调节植株生理和果实发育过程,并在葡萄果实采后SO2保鲜过程中发挥作用,调节果实贮藏期间的生物和非生物胁迫应答.
葡萄、VvWRKY70、生物信息学、转录特征
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S663.1(果树园艺)
国家自然科学基金;国家自然科学基金
2023-09-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共8页
1034-1041