10.3969/j.issn.1002-2481.2023.08.03
毛果杨多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白家族PtPGIP的生物信息学分析
植物多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(Polygalacturonase-inhibiting protein,PGIP)可特异性识别病原菌分泌的多聚半乳糖醛酸酶,从而抑制病原菌对植物细胞壁重要成分——果胶的降解,以增强植物病原菌抗性.为探明模式树种杨树PGIP抗病机制,对毛果杨PGIP(PtPGIP)家族成员进行鉴定,以及对蛋白质理化性质和结构、系统进化、基因表达模式进行分析.结果表明,毛果杨基因组中鉴定到 4个PtPGIP基因,其中,PtPGIP1和PtPGI2位于6号染色体串联重复,PtPGIP3和PtPGIP4位于16号染色体串联重复;PtPGIP1是假基因,PtPGIP2、PtPGIP3、PtPGIP4具有完整的PGIP蛋白结构域.PtPGIP均为疏水蛋白,具有良好的脂溶性,且具有 3～7个N-糖基化位点.亚细胞定位预测表明,其可能定位于细胞外.除PtPGIP1以外,PtPGIP2、PtPGIP3、PtPGIP4蛋白均包含10个LRR片段,LRR中的保守序列xxLxLxx及蛋白质分子对接均表现出差异性.PtPGIP基因的表达具有组织特异性,PtPGIP1基因在各个组织部位的表达水平均较低,PtPGIP2和PtPGIP4基因在根、幼苗、花序中的表达量高于叶片,尤其是PtPGIP2基因在花序中的表达量最高,说明毛果杨PGIP基因家族发生了功能分化,使其在应对多种逆境胁迫中发挥重要作用.
毛果杨、多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白、基因序列、表达模式、蛋白结构
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S792.11(森林树种)
内蒙古自治区高等学校科学研究项目;内蒙古大学引进高层次人才科研启动基金项目
2023-08-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
852-860
