利用SSR创建中国北方黍稷资源DNA身份证

摘要：

利用SSR标记,分析中国北方黍稷种质资源的区别与联系,根据DNA碱基的不同,制作出不同的DNA身份证,即构建字符串DNA分子身份证、条形码DNA分子身份证和二维码DNA分子身份证,为黍稷资源管理和保护提供依据.用14对高基元SSR(六碱基4对、五碱基10对)引物对8个省共20份黍稷资源进行分子身份证的构建,利用PowerMarker 3.25、PopGen 1.32软件计算遗传多样性参数,利用ID Analysis 4.0进行引物组合优化.结果表明,20份材料在10个位点共检测出等位变异10个;Shannon多样性指数(I)为0.7029(RYW7)～1.0880(RYW2),平均为0.9588;观测杂合度(Ho)为0.5000(RYW7)～0.8235(RYW12),平均为0.6866;有效等位变异(Ne)为1.6623(RYW7)～2.7923(RYW12),平均为2.4553;期望观测杂合度(He)为0.4113(RYW7)～0.6862(RYW2),平均为0.6024;多态性信息含量(PIC)为0.4886(RYW3)～0.7766(RYW8),平均为0.6298;Nei's基因多样性指数(Nei)为0.3984(RYW7)～0.6598(RYW2),平均为0.5828.

关键词：黍稷、SSR、DNA条形码、DNA二维码、中国北方

所属期刊栏目：50

分类号：S516(禾谷类作物)

资助基金：现代农业产业技术体系;山西省现代农业产业技术体系建设杂粮项目;国家自然科学基金;山西省自然科学基金

在线出版日期：2022-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：478-485