星豹蛛细胞色素CYP3001U15基因克隆与生物信息学分析

摘要：

星豹蛛是农业害虫的重要捕食性天敌.通过转录组测序鉴定出66条星豹蛛细胞色素P450基因,进一步筛选分析出5条基因,预测其与外源物质代谢有关.为进一步研究星豹蛛细胞色素P450功能和代谢机制,选取其中一条基因进行生物信息学研究.试验通过RT-PCR扩增技术,将星豹蛛总RNA反转录cDNA,后以此为模板进行PCR扩增,回收纯化产物完成单克隆并测序,获取该基因序列信息,并对其进行生物信息学分析.结果发现,克隆到CYP3001U15基因ORF序列,该基因开放阅读框为1074 bp,编码357个氨基酸,分子质量为42 ku,等电点为5.91,原子总数为5808,分子式为C1877H2896N494O531S10;正电荷残基47个,占氨基酸总数的13.2％,负电荷残基52个,占氨基酸总数的14.6％;蛋白的二级结构预测结果显示,α螺旋占47.62％,β折叠占8.96％,β转角占4.76％,无规则卷曲占38.66％;亚细胞定位预测结果显示,其定位在细胞内质网上;蛋白信号肽预测结果显示,该蛋白不存在信号肽;跨膜结构预测分析结果显示,其不存在跨膜结构.研究结果可就星豹蛛细胞色素P450基因对杀虫剂等外源物代谢的研究提供理论基础.

关键词：星豹蛛、细胞色素P450、基因克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：48

分类号：Q813.2(生物工程学(生物技术))

资助基金：农业农村部农产品质量安全监管专项;山西省高等学校科技研究优秀成果培育项目

在线出版日期：2020-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：842-846