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10.3969/j.issn.1002-2481.2020.04.01

谷子OFP基因家族的鉴定及表达分析

引用
谷子是我国重要的粮饲作物,具有抗旱耐贫瘠的特点,OFP家族是植物特有的一类调节植物生长和发育的转录因子,参与调控植物的抗逆性.为了探索谷子OFP家族基因的特征和功能,通过基因定位、基因结构分析、motif预测、进化分析与顺式作用元件分析及亚细胞定位预测来解析谷子OFP家族基因的特征,分析谷子与拟南芥和水稻基因组中的OFP家族基因的共线性、选择压力,最后分析谷子OFP家族基因的表达模式.结果表明,共筛选到谷子OFP家族基因34个,分布在8条染色体上;进化分析发现,谷子OFP家族基因可以分为3个亚类;motif预测中共鉴定到8个motif基序;顺式作用元件分析发现,与干旱响应相关的OFP基因共22个;与拟南芥的5个基因、水稻的31个基因存在共线性;18个OFP家族基因被预测定位到细胞核内;谷子OFP家族基因在穗中表达量最多,干旱胁迫下的OFP基因大多表现下调,具有时空特异性.OFP家族基因Seita.2G184300、Seita.7G093000、Seita.3G008900的表达差异可能是造成豫谷1号和安-04抗旱性差异较大的原因之一.结果可为谷子OFP家族基因的功能研究提供基础.

OFP基因家族、谷子、抗旱、表达分析

48

S515(禾谷类作物)

国家自然科学基金项目;山西省重点研发计划项目;山西省青年科技研究基金项目;山西农业大学校基金项目;山西农业大学科技创新基金项目

2020-05-07(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共10页

467-476

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山西农业科学

1002-2481

14-1113/S

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2020,48(4)

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