丹皮治疗新型冠状病毒肺炎的有效成分、核心靶点及作用机制

摘要：

目的 基于网路药理学和分子对接技术探讨丹皮治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的有效成分、核心靶点及潜在作用机制.方法 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取丹皮的有效成分及作用靶点,Gene-Cards?和OMIM?数据库获得COVID-19相关靶点,两者取交集后获得丹皮治疗COVID-19的潜在靶点.将潜在靶点输入STRING数据库,获取靶点蛋白在生物系统中的相互作用关系,建立蛋白互作网络(PPI)图筛选核心靶点,采用Cytoscape软件绘制COVID-19-丹皮—有效成分—靶点网络图,筛选丹皮主要活性成分.对潜在靶点进行GO和KEGG富集分析,获取潜在靶点的相关分子功能和信号通路.采用Discovery Studio 2019软件对靶点网络图中丹皮主要活性成分及临床常用于治疗COVID-19的药物奈玛特韦、瑞德西韦与COVID-19的药物治疗靶点3CL蛋白酶、血管紧张素转化酶2(ACE2)进行分子—蛋白对接.结果 共获得丹皮有效成分6个,即槲皮素、丁子香萜、谷甾醇、山奈酚、(+)-儿茶素、单体5-{[5-(4-甲氧基苯基)-2-呋喃]亚甲基}巴比妥酸(简称巴比妥酸),有效成分作用靶点150个,与COVID-19相关靶点716个取交集后获得丹皮治疗COVID-19的潜在靶点36个.PPI图显示核心靶点主要包括血管内皮细胞生长因子受体(VEGFR)、白细胞介素6(IL-6)、IL-1B等.COVID-19-丹皮—有效成分—靶点网络图显示,丹皮治疗COVID-19的主要活性成分排名先后顺序为槲皮素、山奈酚、巴比妥酸和(+)-儿茶素,核心靶点为过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、环加氧酶2(PTGS2)、雌激素受体1(ESR1).GO和KEGG富集分析得到61个分子功能和109个信号通路,分子功能主要包括细胞因子受体结合活性、DNA结合转录因子结合活性、信号受体激活因子活性等,信号通路主要包括脂质与动脉粥样硬化、IL-17、肿瘤坏死因子(TNF)家族等.分子—蛋白对接结果显示,与奈玛特韦、瑞德西韦相比,丹皮有效成分巴比妥酸和槲皮素分别与3CL蛋白酶和ACE2有更稳定的结合能力.结论 丹皮通过有效成分槲皮素、巴比妥酸、(+)-儿茶素、山奈酚作用于PPARG、PTGS2、ESR1等核心靶点对COVID-19发挥治疗作用,其机制主要与调控脂质与动脉粥样硬化、IL-17、TNF等通路有关.

关键词：丹皮、网络药理学、分子对接、槲皮素、血管内皮细胞生长因子受体、新型冠状病毒肺炎

所属期刊栏目：63

分类号：R969.4(药理学)

资助基金：安徽省高校自然科学研究重点项目;安徽医科大学校科研基金项目;安徽医科大学校科研基金项目

在线出版日期：2023-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：19-23