多发性骨髓瘤/浆细胞白血病差异表达基因生物学功能、关键基因表达水平及其与预后的关系

摘要：

目的 筛选出多发性骨髓瘤(MM)与浆细胞白血病(PCL)之间的差异表达基因,了解其生物学功能,明确关键基因表达水平与MM预后的关系.方法 从公共基因芯片数据库(GEO)中下载MM与PCL芯片数据集GSE66291和GSE70323,在R软件中用Limma包分别筛选差异表达基因(DEGs)并取交集.利用基因本体(GO)以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析对DEGs进行功能和通路注释,使用Sring对交集的DEGs构建蛋白质—蛋白质互作网络(PPI),筛选关键基因,使用Cytohubba插件筛选相关度前20位的关键基因,最后在GSE24080中根据关键基因的表达水平将MM患者分为高表达组及低表达组,比较高低表达组的总体生存率.结果 共获取DEGs 389个,120个上调,269个下调.GO分析结果显示:在细胞组分方面主要与细胞膜外区域相关;在生物过程方面,参与白细胞游走、中性粒细胞聚集、体液免疫等;分子功能方面,主要与抗原结合相关.KEGG结果提示DEGs在细胞黏附分子、局灶性黏附等相关通路上富集.筛选出CDH1、CD44等20个关键基因,其中CX-CL12、CDH1、RNASE3、LYZ、PPBP、VCAM1、QPCT、PECAM1与MM高表达组MM患者的总体生存率高于低表达组(P均<0.05).结论 MM与PCLD的DEGs中120个上调,269个下调.DEGs主要与细胞膜外区域相关,参与白细胞游走、与抗原结合、调控细胞黏附分子及局灶性黏附等相关通路.CXCL12、CDH1、RNASE3、LYZ、PPBP、VCAM1、QPCT和PECAM1可能是与MM患者预后相关的关键基因,其高表达组MM患者预后较好.

关键词：多发性骨髓瘤、浆细胞白血病、差异基因、基因本体功能分析、京都基因与基因组百科全书信号通路分析、预后

所属期刊栏目：63

分类号：R551.3(血液及淋巴系疾病)

资助基金：国家自然科学基金82200225

在线出版日期：2023-03-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：44-47