矽肺大鼠肺组织差异表达环状RNA的筛选及其生物学功能和调控通路分析

摘要：

目的 筛选矽肺大鼠肺组织中的差异表达环状RNA(circRNA),并分析其生物学功能、相关调控通路.方法 将20只SPF级Wistar雄性大鼠随机分成模型组和对照组,每组10只,分别采用非暴露法气管内一次性灌注SiO2粉尘悬液、灭菌生理盐水各1 mL.两组分组处理30 d,处死后取肺组织,采用高通量circRNA芯片技术筛选两组大鼠肺组织差异表达的circRNA,使用基因本体论(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析差异表达circRNA的生物学功能及相关通路.结果 共筛选出两组大鼠肺组织差异表达circRNA 1129个,其中表达上调的circRNA 293个,表达下调的circRNA 836个.GO功能分析结果显示:分子功能层面,差异表达的circRNA主要影响蛋白质结合蛋白、离子结合、蛋白质的催化活性、蛋白激酶活性;细胞组成层面,差异表达的circRNA主要影响细胞连接、突触、细胞内膜结合、细胞器、细胞内细胞器;生物学过程层面,差异表达的circRNA主要影响阴离子结合、ATP结合、磷酸转移酶活性、蛋白激酶活性.KEGG信号通路分析结果显示,矽肺大鼠肺组织差异表达的circRNA主要与癌症、环磷酸鸟苷—蛋白激酶G(cGMP)—蛋白激酶G(PKG)信号通路、酪氨酸激酶抑制剂耐药性、血管平滑肌收缩、表皮生长因子受体(EGFR)信号通路、钙离子信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、甲状旁腺激素的合成与分泌、谷氨酸能突触等通路相关.结论 矽肺大鼠肺组织差异表达circRNA 1129个,其中表达上调的cir-cRNA 293个、表达下调的circRNA 836个,主要影响蛋白质结合蛋白、离子结合等分子功能,细胞连接、突触等细胞组成,阴离子结合、ATP结合等生物学过程,并涉及调控MAPK、EGFR、癌症和钙离子信号通路等.

关键词：环状RNA、矽肺、蛋白质结合蛋白、离子结合、表皮生长因子受体信号通路

所属期刊栏目：62

分类号：R135(劳动卫生)

资助基金：山东省济南市科学技术发展计划第五批项目201805071

在线出版日期：2023-01-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：44-47