基于基因数据集和分子对接技术的非小细胞肺癌EGFR-TKIs耐药/敏感相关核心基因筛选

摘要：

目的 基于基因数据集和分子对接技术筛选非小细胞肺癌表皮生长因子受体(EGFR)-酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)相关基因,并观察其对EGFR-TKIs药物(阿法替尼、奥斯替尼、厄洛替尼、吉非替尼)敏感性的影响.方法 收集GEO数据库4个基因数据集中非小细胞肺癌EGFR-TKIs耐药细胞系、敏感细胞系的差异表达基因,获得共同差异表达基因.基于CellMiner数据库使用Pearson相关分析法分析共同差异表达基因与EGFR-TKIs半数抑制浓度(IC50)之间的相关性,初步筛选基因—药物对,采用分子对接的方法对基因—药物对进行筛选验证.结果 4个基因数据集中EGFR-TKIs敏感细胞系共同的上调基因42个,共同的下调基因14个.初步筛选出符合标准的基因—药物对共16对,其中包含7个EGFR-TKIs相关基因,分别为脂多糖诱导肿瘤坏死因子(LITAF)、黏蛋白16(MUC16)、酪氨酸激酶受体2(ERBB2)、特异性雄激素调控基因116(C1orf116)、肌盲样蛋白3(MBNL3)、脾酪氨酸激酶(SYK)、四跨膜蛋白基因(TSPAN4),其中LITAF、MUC16、ERBB2、C1orf116、MBNL3、SYK表达与EGFR-TKIs的IC50呈负相关关系(P均<0.05),TSPAN4表达与EGFR-TKIs的IC50呈正相关关系(P均<0.05).分子对接结果显示,16对基因—药物对中仅5对EGFR-TKIs关键成分与对应靶点具有良好的结合活性,分别为ERBB2-阿法替尼、ERBB2-奥斯替尼、ERBB2-厄洛替尼、MUC16-阿法替尼、MUC16-厄洛替尼、MUC16-吉非替尼.结论 非小细胞肺癌EGFR-TKIs耐药/敏感相关的核心基因为MUC16、ERBB2,MUC16过表达能提高阿法替尼、厄洛替尼的敏感性,ERBB2过表达能提高阿法替尼、厄洛替尼、奥斯替尼的敏感性.

关键词：耐药基因、药物敏感性、表皮生长因子受体、酪氨酸激酶抑制剂、非小细胞肺癌

所属期刊栏目：62

分类号：R734.2(肿瘤学)

资助基金：湖北省自然科学基金资助项目2019CFB306

在线出版日期：2023-01-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：5-9