基于TCGA数据库胶质母细胞瘤患者预后铁死亡基因相关lncRNA预测模型构建

摘要：

目的 构建基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库胶质母细胞瘤(GBM)患者预后铁死亡基因相关lncRNA预测模型.方法 通过TCGA数据库获取GBM的高通量测序数据,通过文献检索和搜查FerrDb数据库两种方式获取铁死亡基因,并基于GBM中铁死亡相关差异表达的lncRNA构建GBM预后的多lncRNA模型,分析预后lncRNA与铁死亡基因的共表达关系.结果 共获得与GBM相关的铁死亡基因246个,铁死亡相关lncRNA 2624个,经差异分析和降维处理,最终得到102个与GBM显著相关的铁死亡基因,并构建了一个包含111个lncRNA的GBM预后模型,其中,69个差异有统计学意义的铁死亡基因与73个GBM预后相关的铁死亡lncRNA之间存在共表达关系.Kaplan-Meier生存曲线显示,在预后模型下,高危者和低危者的总生存率差异有统计学意义(P<0.01).结论 基于TCGA数据库成功构建GBM患者预后铁死亡基因相关lncRNA预测模型,该模型可在一定程度上预测GBM患者的生存率.

关键词：胶质母细胞瘤、铁死亡、长链非编码RNA、生物信息学、TCGA

所属期刊栏目：62

分类号：R739.41(肿瘤学)

在线出版日期：2022-12-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：64-67