心脏外科手术后房颤差异表达基因筛选及功能分析
万方数据知识服务平台
应用市场
我的应用
会员HOT
万方期刊
×

点击收藏,不怕下次找不到~

@万方数据
会员HOT

期刊专题

10.3969/j.issn.1002-266X.2021.32.008

心脏外科手术后房颤差异表达基因筛选及功能分析

引用
目的 筛选心脏外科手术后房颤(POAF)的差异表达基因,并进行功能分析.方法 从GEO数据库获取1个基因表达谱数据集GSE143924,样本来源于心外科手术患者心外膜脂肪组织.根据术前特征对15例POAF患者(病例组)和15例术后窦性心律患者(对照组)进行匹配.通过GEO2R在线分析病例组和对照组差异表达基因,对差异表达基因进行GO分析及KEGG分析,构建蛋白与蛋白相互作用(PPI)网络,筛选Degree前10位的基因为POAF的关键基因.结果 共筛选获得病例组和对照组的254个差异表达基因,病例组较对照组表达上调82个、表达下调172个.GO和KEGG分析显示,差异表达基因涉及的信号通路主要与补体和凝血级联等相关,生物学过程主要集中在细胞黏附、免疫反应等.PPI网络筛选得到10个关键基因分别为TLR2、CDH2、VTN、CCL2、KDR、C1QA、BMP2、ZAP70、HP、CFB,这些基因主要调控炎症反应及免疫反应.结论 POAF差异表达基因涉及的信号通路主要与补体和凝血级联等相关,生物学过程主要集中在细胞黏附、免疫反应等,炎症反应和免疫反应在POAF的发生发展中起关键作用.

房颤;心脏外科手术;关键基因;生物信息学;信号通路;功能分析

61

R541.7(心脏、血管(循环系)疾病)

2021-12-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共4页

32-35

相关文献
评论
暂无封面信息
查看本期封面目录

山东医药

1002-266X

37-1156/R

61

2021,61(32)

相关作者
相关机构

专业内容知识聚合服务平台

国家重点研发计划“现代服务业共性关键技术研发及应用示范”重点专项“4.8专业内容知识聚合服务技术研发与创新服务示范”

国家重点研发计划资助 课题编号:2019YFB1406304
National Key R&D Program of China Grant No. 2019YFB1406304

©天津万方数据有限公司 津ICP备20003920号-1

信息网络传播视听节目许可证 许可证号:0108284

网络出版服务许可证:(总)网出证(京)字096号

违法和不良信息举报电话:4000115888    举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn

举报专区:https://www.12377.cn/

客服邮箱:op@wanfangdata.com.cn