溃疡性结肠炎的关键致病基因及治疗中药活性成分筛选

摘要：

目的 运用生物信息学方法分析与溃疡性结肠炎(UC)发病的关键致病基因,筛选可能用于靶向治疗UC的中药活性成分.方法 从GEO数据库获取UC相关基因芯片数据集(GSE87466),纳入87例UC患者结肠黏膜组织标本(包括27例广泛性UC样本和60例局限性UC样本)和21例健康成人结肠黏膜组织标本,筛选UC患者及正常成人结肠黏膜组织显著性差异表达基因(DEGs),运用DAVID数据库对上述DEGs进行基因本体和信号通路富集分析,采用STRING及Cytoscape对与UC发病相关的DEGs进行蛋白质互作网络(PPI)分析UC核心致病基因.采用比较毒物基因组学数据库对UC致病核心基因与相关中药活性成分进行互联,得到可能用于治疗UC的中药活性成分.结果 与UC发病相关的核心基因包括白介素-8、基质金属蛋白酶9、表皮生长因子、白细胞介素1β、趋化因子2、趋化因子1、白细胞介素-10及白介素-2.可用于靶向治疗UC的中药成分包括白藜芦醇、槲皮素、姜黄素等.结论 与UC发病相关的DEGs有279个,核心基因有白细胞介素-8、基质金属蛋白酶9等8个;获得白细胞藜芦醇、槲皮素等46个可用于治疗UC的中药活性成分.

关键词：白介素-8、基质金属蛋白酶9、表皮生长因子、炎症反应、趋化因子、白藜芦醇、槲皮素、溃疡性结肠炎

所属期刊栏目：61

分类号：R587.2(内分泌腺疾病及代谢病)

资助基金：国家自然科学基金;湖南省自然科学基金;湖南省教育厅科学研究项目;湖南中医药大学校级科研基金项目

在线出版日期：2021-07-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：33-38