环境化学物暴露对妊娠期糖尿病生物信息学的影响

摘要：

目的 探讨妊娠期糖尿病(GDM)共同关联基因参与的富集进程及信号通路并进一步研究影响GDM的环境化学物质.方法 从GEO数据库中获取GDM关联的基因,通过比较毒理基因组学数据库获取直接作用的GDM相关基因及化学物质,并筛选出二者共同的GDM关联基因.采用DAVID在线软件对GDM关联的基因进行基因本体论(GO)分析和BIOCARTA信号通路分析,采用String在线软件和Cytoscape软件对GDM关联的基因进行蛋白互作网络分析.结果 共发现有59个与GDM关联的基因.GO分析显示与GDM关联的基因主要集中在细胞外基质组织、血管再生、胚胎肢体形态发育、单生物细胞-细胞黏附以及细胞外区域等;BIOCARTA信号通路富集分析显示GDM共同的关联基因主要参与了IL-10抗炎信号通路、Ghrelin信号通路.蛋白互作网络分析显示GDM共同的关联蛋白共有6个模块,影响各个模块的环境化学物质主要为砷、莠去津、镉、二嗪农、二甲双胍、农药等.结论 环境化学物质能在基因/蛋白水平上影响GDM的发生发展.

关键词：妊娠期糖尿病、环境化学物、基因本体论、BIOCARTA分析、蛋白互作网络

所属期刊栏目：61

分类号：R714.25(妇产科学)

资助基金：青岛市科技局立项项目;青岛糖尿病预防项目;青岛糖尿病预防项目;青岛市医药科研指导计划;青岛市医药科研指导计划

在线出版日期：2021-05-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：56-58,62