肺腺癌预后关键基因的筛选、验证及其调控通路分析

摘要：

目的 筛选肺腺癌预后关键基因并进行验证,分析其调控通路.方法 从TCGA和GEO数据库获取肺腺癌转录组数据,筛选共同差异表达基因.将LASSO引入到COX回归模型中,进一步筛选预后关键基因.计算TC-GA数据库获得的500例肺腺癌患者的预后关键基因相关风险评分,以风险评分中位数作为临界值将患者分为高风险组和低风险组,比较两组5年生存率.采用GEPIA数据库分析癌组织预后关键基因表达,Kaplan Meier-plotter数据库分析预后关键基因表达与肺腺癌患者预后的关系.采用基因集变异分析(GSVA)预测肺腺癌预后关键基因的调控通路.结果 在TCGA、GEO数据库共得到166个共同差异表达基因,回归分析筛选出DCN、RRAS、ECT2和PCP4是肺腺癌预后关键基因.高、低风险组5年生存率分别为29.3％、48.4％,两组比较P<0.01.肺腺癌组织中DCN、RRAS mRNA表达均低于正常肺组织,PCP4、ECT2 mRNA表达均高于正常肺组织(P均<0.05).RRAS、PCP4、ECT2高表达者5年生存率明显低于低表达者,DCN高表达者5年生存率明显高于低表达患者(P均<0.01).GSVA结果显示,DCN、RRAS、ECT2和PCP4可能通过调节细胞周期、DNA损伤修复等途径影响肺腺癌患者的预后.结论 DCN、RRAS、ECT2和PCP4是肺腺癌患者预后相关的关键基因,癌组织RRAS、PCP4、ECT2表达升高及DCN表达降低

关键词：肺腺癌、TCGA数据库、GEO数据库、预后、差异表达基因、生存分析

所属期刊栏目：60

分类号：R734.2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目;河北省自然科学基金重点项目;河北省高等学校创新团队领军人才培育计划

在线出版日期：2020-09-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1-5