膀胱癌组织某一特异性EST片段全长扩增及生物信息学分析

摘要：

目的 对膀胱癌组织某一特异性表达序列标签(EST)片段迸行全长扩增及生物信息学分析.方法 收集1例迸行手术的膀胱癌患者(病理证实为膀胱移行细胞癌)的癌组织,从新鲜的膀胱癌组织中提取RNA,利用RACE方法获取前期研究发现的某一特异性EST片段5′端和3′端DNA序列,通过GeneTool软件合成RACE测序结果.对全长序列及其相应蛋白迸行生物信息学分析,利用sequin软件编辑分析结果,并向NCBI提交获取基因号及蛋白号.结果 成功获得该特异性EST片段的5′端和3′端,利用GeneTool软件合成一个1839 bp的全长序列,初步分析其含有完整的开放阅读框(ORF),染色体定位于17p13.3.该序列在GeneBank获得基因号为KR780251, ORF翻译的多肽序列获得蛋白ID为AKO62675.结论 该膀胱癌组织特异性EST片段基因号为KR780251,全长序列为1839 bp,含有完整的ORF,其编码蛋白AKO62675可能是正常膀胱组织的基因突变体.

关键词：膀胱癌、基因、表达序列标签片段、变异、KR780251、AKO62675、生物信息学

所属期刊栏目：58

分类号：R737.14(肿瘤学)

资助基金：山西省卫计委科研课题基金资助项目201201077

在线出版日期：2018-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：18-21