广泛期与局限期小细胞肺癌差异表达miRNAs的筛选及生物信息学分析

摘要：

目的 筛选广泛期与局限期小细胞肺癌(SCLC)间差异表达的miRNAs,分析差异表达miRNAs的靶基因功能.方法 从高通量基因表达数据库中下载SCLC转移基因芯片数据GSE67804,采用Qlucore Omics Explorer3.0软件筛选广泛期SCLC(ED组)、局限期SCLC(LD组)患者血清中的差异表达miRNAs,通过生物信息学方法预测差异miRNAs靶基因,并对靶基因迸行 GO 功能富集分析、KEGG 信号通路分析以及 STRING 蛋白互作分析.结果 ED组与LD组筛选出17个差异表达miRNAs(P<0.05,|Fold change|≥2).生物信息学分析发现,差异miRNAs互补结合的靶基因在胞吞作用、Ras通路、Rap1通路、PI3K-Akt通路、局部黏附等肿瘤相关通路明显富集,靶基因信号传导及转录激活因子(STAT3)、SMAD3、E2F1、基质金属蛋白2(MMP2)、SP1、雄激素受体(AR)、胰岛素样生长因子1受体(IGF1R)、核因子κB1(NFκB1)、蛋白激酶2(AKT2)编码的蛋白在互作网络中具有核心地位.结论 广泛期与局限期SCLC间存在17个差异表达miRNAs,这些miRNAs可能通过调控Ras、Rap1、PI3K-Akt等信号通路,迸而调节下游靶蛋白参与SCLC转移的发生过程.

关键词：小细胞肺癌、肿瘤转移、微小RNA、生物信息学、基因芯片

所属期刊栏目：58

分类号：R734.2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目81460059;兵团博士基金资助项目2014BB019

在线出版日期：2018-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1-4