呼吸道合胞体病毒F蛋白二级结构分析及其B细胞表位预测

摘要：

目的：分析呼吸道合胞体病毒（RSV） F蛋白的二级结构并预测其B细胞表位。方法分析RSV F蛋白的二级结构，得出RSV F蛋白中可能出现的信号肽序列以及位置。基于同源建模的方法预测RSV F蛋白的三级结构，以三级结构为基础预测F蛋白中可能存在的构象B表位和线性B表位。结果 F蛋白的574个编码氨基酸中占主要比例的是丝氨酸（10．45％）、亮氨酸（10．28％）、天冬酰胺（8．71％）和苏氨酸（8．71％）；可能有7个蛋白结合位点、6个产生螺旋结构的区域；可能存在两个主要的β-折叠片蛋白；F蛋白N-末端第1～25区段为信号肽。 RSV F蛋白头部主要由β-折叠片、无规则卷曲和转角组成，尾部主要由两段长的α-螺旋组成。 RSV F蛋白中可能存在4个构象B表位、8个线性B表位。结论 F蛋白编码氨基酸主要为丝氨酸和亮氨酸，可能有7个蛋白结合位点、6个产生螺旋结构的区域、两个主要的β-折叠片蛋白。RSV F蛋白中可能存在4个构象B表位、8个线性B表位。

关键词：呼吸道合胞体病毒、F蛋白、蛋白二级结构、B细胞表位

所属期刊栏目：56

分类号：R392.11

资助基金：国家自然科学基金青年科学基金项目81400013；广东省科技计划自助项目2014A020212329。

在线出版日期：2016-08-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：20-23