10.3969/j.issn.1002-266X.2015.48.001
激素性股骨头坏死患者血浆 microRNA表达谱及生物信息分析
目的:分析激素性股骨头坏死( SONFH)患者血浆microRNA表达谱变化及生物信息内容,并探讨其意义。方法选取SONFH患者(观察组)和健康志愿者(对照组)各6例,采用Real-time PCR法检测其血浆microR-NA相对表达量,筛选差异表达的microRNA。采用TargetScan、mirBase及miRanda三个在线数据库预测交集靶基因,分别进行功能富集性分析和信号转导通路富集(Pathway)分析。结果共检测768个microRNA,两组差异表达的microRNA 16个,其中观察组上调10个,比较明显的是hsa-miR-1207-5p和hsa-miR-887(观察组/对照组>3);下调6个,比较明显的是hsa-miR-96-5p、hsa-miR-576-5p(观察组/对照组<0.5)。三个在线数据库共筛选出交集靶基因887个,其中上调microRNA 483个,hsa-miR-1207-5p未检出交集靶基因,hsa-miR-887检出交集靶基因为GSK3A和CASK;下调microRNA 404个,hsa-miR-96-5p检出交集靶基因114个,hsa-miR-576-5p检出59个。功能富集性分析显示,两组差异表达microRNA调控的靶基因功能主要包括解剖结构形态、间充质细胞增殖、细胞代谢过程等, Pathway分析显示靶基因明显富集于各种信号通路。结论 SONFH患者血浆microRNA 明显上调的是hsa-miR-1207-5p和hsa-miR-887,明显下调的是hsa-miR-96-5p、hsa-miR-576-5p,microRNA异常表达可能通过各信号通路参与SONFH的发病。
股骨头坏死、糖皮质激素、微小RNA、基因表达谱
R681.8(骨科学(运动系疾病、矫形外科学))
国家自然科学基金资助项目81373652。
2016-01-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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